Поскольку среди оставшихся депутатов (около 100 человек; их стали именовать «парламентским охвостьем»)
В течение 1648 г.
произошла вторая гражданская война. На стороне короля выступили аристократические кланы Шотландии, командный состав флота, роялистские группировки графств Центральной Англии. Армия, руководимая О. Кромвелем, нанесла мятежникам решительное поражение. В декабре 1648 г. в парламент был внесен билль о суде над королем, обвиняемым в национальной измене.Период республики. Новый, 1649 г. знаменовал вступление революции во второй, высший этап ее развития. В кратчайший срок были приняты один за другим несколько важнейших актов, полностью перестроивших всю дореволюционную систему государственных органов. 4 января 1649 г. был принят закон о признании нижней палаты парламента (палаты общин) верховной властью в государстве, в том числе по отношению к палате лордов и королю. В законе говорилось, что «народ, ходящий под Богом, является источником всякой законной власти» и что акты, принятые палатой общин, приобретают силу закона даже в том случае, когда король или палата лордов не дадут на это своего согласия. Весьма показательными в этом документе являлись две принципиально важные идеи — во-первых, провозглашение народного суверенитета в качестве основы всякой власти; во-вторых, признание полномочий палаты общин законодательно не ограниченными.
В том же январе 1649 г. был создан чрезвычайный верховный суд в составе 135 чел. для решения вопроса о судьбе короля. Кворум для правомочности заседаний суда был определен в 20 чел. (в дальнейшем на заседания суда являлось не менее 60 чел.; впрочем, 47 членов суда ни разу не участвовали в его заседаниях). Председателем суда был избран видный юрист Д. Бредшоу.
После длительной ожесточенной борьбы мнений этот суд высказался за предание Карла I смертной казни (под приговором стояли 59 подписей членов суда). Приговор был оглашен 27 января 1649 г., казнь была осуществлена 30 января.Казнь короля явилась формально-юридическим закреплением уже сложившейся к тому времени республиканской государственной системы. 17 марта 1649 г. был принят парламентом Акт об отмене королевского звания, поскольку оно «бесполезно, тягостно и опасно для свободы, общественной безопасности и публичного интереса народа». Так как мероприятия коммонеров вызывали обструкцию со стороны палаты лордов, не мирившейся с утратой своего верховенства в парламенте, О. Кромвель и его сторонники добились принятия билля о роспуске и ликвидации верхней палаты (19 марта 1649 г.). Этот шаг мотивировался мотивировался тем, «что продолжение существования палаты лордов бесполезно и опасно для английского народа».
21 марта 1649 г. парламент издал специальную декларацию, в которой обосновал произошедшие перемены в государственном устройстве страны. Эти перемены завершились принятием акта 19 мая 1649 г., согласно которому Англия официально провозглашалась «республикой и свободным государством» (Commonwealth and Free State), которое управляется «верховной властью английской нации, представителями народа в парламенте и теми, которых они назначат и определят в качестве подчиненныхим должностных лиц и чиновников, ко благу народа и без какого бы то ни было короля и палаты лордов».