Микрофлора почвы
Почва - естественная среда обитания микроорганизмов. Характер почвы и видовой состав ее микрофлоры неразрывно связаны. Основное место обитания микроорганизмов - твердая фаза, содержащая запасы питательных веществ.
До 90% микроорганизмов находится в адсорбированном состоянии на поверхности почвенных частиц.Плотность микробного населения определяется, прежде всего, органическими веществами. Так, в 1 г чернозема содержится до 3 млрд. клеток микроорганизмов; в бедных органическими веществами подзолистых почвах - от 300 млн до 2 млрд, в песках пустыни Сахары, где влияет и низкая влажность
среды, - около 1 млн.
Почвы различаются по содержанию воды: слишком сухие и слишком влажные ограничивают рост и развитие микроорганизмов. Оптимальна для большинства микроорганизмов влажность, равная 50-60% максимальной влагоемкости (наибольшего количества воды, которое почва может удерживать). Некоторые, например Clostridium pasteurianum, могут расти при 100 %-й влагоемкости почвы. Для микроорганизмов важна концентрация солей в почвенном растворе. Засоленные почвы беднее микроорганизмами, однако некоторые грибы родов Aspergillus, Peniclillium хорошо развиваются на субстратах с 20-30% NaCl, некоторые почвенные микроорганизмы развиваются при высоких концентрациях минеральных солей (осмофильные).
Почвенный воздух отличается по составу от атмосферного. Экологически важным компонентом почвенного воздуха является количество СО2, необходимого для автотрофных организмов. При растворении в воде он образует кислоту и, изменяя рН почвы, становится фактором, ограничивающим жизненные процессы микроорганизмов. Например, гриб Rhizoctonia solani погибает при концентрации СО2 10%. Почвенные микроорганизмы очень чувствительны к изменениям рН среды: грибы лучше растут в кислой среде, а бактерии - в нейтральной или слегка щелочной. Изменение рН почвы вызывает изменения в популяциях почвенных микроорганизмов.
Из внешних факторов, существенно влияющих на развитие микроорганизмов в почве, основным является температура. Лучше всего почвенные микроорганизмы развиваются при температуре 15-25 °С, но могут встречаться термофильные (оптимум 50 °С) и криофильные, развивающиеся при температуре, близкой к 0 °С. Микроорганизмы обитают главным образом в самом верхнем аккумулятивном, или перегнойном, горизонте почвенного профиля, отличающегося большой амплитудой колебаний температур, зависящей от времени года, характера местности и даже от времени суток, от температуры воздуха, поэтому почвенные микроорганизм обладают большой пластичностью в отношении температур.
Почвенные микроорганизмы неодинаково распространены по горизонтам почвы. Наибольшее количество микроорганизмов обитает в верхнем 10сантиметровом слое почвы. В нижних горизонтах органических веществ мало и большинство бактерий находится в покоящемся состоянии, в основном в виде цист и спор. Чем глубже расположен горизонт почвы, тем меньше в нем микроорганизмов.
На распределение микроорганизмов в почве влияют корни растений, выделяющие во внешнюю среду органические вещества. На поверхности корней и в прикорневой зоне сосредоточено большое количество микроорганизмов.
Наиболее многочисленной группой среди микроорганизмов всех типов почв являются бактерии, составляющие от 65 до 96% общего числа клеток. В почвах, богатых гумусом (дерново-подзолистых, лесных и горно-луговых), влажных и холодных, преобладают неспорообразующие формы. В бурых и пустынных почвах с низким содержанием органических веществ и влаги при высокой температуре развиваются преимущественно споровые бактерии, более устойчивые к действию засухи и перегрева.
Количество грибов в почве не превышает 0,5-0,8% общего числа микроорганизмов и зависит от рН почвы. В сильно кислых подзолистых почвах (при рН около 4) грибы составляют до 3% всех микроорганизмов.
Различные виды обработки почв (рыхление, орошение, вспашка, внесение удобрений) способствуют усиленному размножению микроорганизмов, поэтому в окультуренных почвах число их в несколько раз больше, чем в целинных.
Из микробиологических процессов, происходящих в почве, наибольшее значение имеют минерализация растительных и животных остатков, образование гумуса и его разложение. В растительном опаде содержатся сахара, аминокислоты, белки, которые быстро потребляются микроорганизмами, Минерализация нерастворимых в воде соединений (целлюлозы, гемицеллюлозы) идет медленно, с участием немногих видов, прежде всего грибов. Лигнин - главный исходный продует для образования гумуса - наиболее устойчивое соединение и разлагается микроорганизмами очень медленно - месяцы и годы.
Почвенные микроорганизмы условно подразделяются на несколько групп. Микроорганизмы, разлагающе свежий растительный опад, С. Н.Виноградский назвал зимогенной микрофлорой. В основном это бактерии родов Bacillus, Pseudomonas и др. Если в почве мало легкоразлагаемых питательных веществ, зимогенные микроорганизмы переходят в покоящуюся форму или даже погибают.
Автохтонные микроорганизмы постоянно живут в почве, и численность их не зависит от поступления легкодоступных питательных веществ. Характерный представитель этой группы - бактерии рода Arthrobacter. Автохтонные микроорганизмы принимают активное участие в синтезе гумуса (автохтонная микрофлора А) и его распаде (автохтонная микрофлора Б).
Олиготрофные микроорганизмы - виды, способные усваивать питательные вещества из растворов с низкой концентрацией. Это бактерии родов Microcyclus, Hyphomicrobium, Agrobacter, Caulobacter и др.
Хемолитоавтотрофные бактерии - почвенные микроорганизмы, окисляющие неорганические субстраты. Группа включает нитрифицируюшие, тионовые, водородные, железобактерии и др.
В разных типах почв соотношение групп бактерий неодинаково, изменяется и видовой состав представителей различных групп. Количественные показатели содержания микроорганизмов зависят от метода исследования.
Почва подвергается колоссальному антропогенному воздействию, по
ступающие в почву загрязнители оказывают неблагоприятное воздействие на свойства почвы, ее плодородие, урожайность возделываемых культур.
Большую угрозу для почвы представляют загрязнения нефтью. Кроме того, существуют и другие весьма опасные для почвы типы загрязнений. Почва - естественное депо, где накапливаются остатки пестицидов, тяжелые металлы поглощаются почвенными частицами и оказывают пагубное влияние на живущие в почве организмы. Стойкие пестициды накапливаются в почве и загрязняют окружающую среду и сельскохозяйственную продукцию. Иногда при их частичном разрушении образуются соединения, гораздо более токсичные и устойчивые, чем внесенные препараты. Однако и сама почва может служить местом очистки различного рода загрязнений; ее самоочищение в значительной степени зависит от деятельности почвенных микроорганизмов. На основе комменсализма и в условиях кометаболизма, или соокисления, может происходить полная минерализация загрязняющих органических веществ в почве.Выделение почвенных микроорганизмов на питательных средах
Микробиологическое исследование включает определение общего количества сапротрофных микроорганизмов, определение количества микроорганизмов различных эколого-трофических групп, определение микробов- антагонистов и выявление их активности, определение санитарнопоказательных микроорганизмов (кишечной палочки).
Для обеспечения роста микроорганизмов в искусственных условиях используют питательные среды, которые должны соответствовать следующим требованиям:
1. Содержать все элементы, из которых строится клетка
2. Иметь достаточную влажность (не менее 20% воды)
3. Концентрация солей в среде должна обеспечить изотонию, т.е. соответствовать концентрации солей в микробной клетке (для большинства микроорганизмов - 0,5%; галофильных - 3 %)
4. Концентрация водородных ионов (рН) среды должна быть оптимальной для выращиваемого организма (диапазон рН 4,5-8,5)
5. Окисилительно-восстановительный потенциал (Eh) среды, определяющий концентрацию кислорода в среде, должен соответствовать потребностям микроорганизма: для анаэробов - 0,12-0,06 В, для аэробов - более 0,08 В.
Таким образом, должен соблюдаться принцип создания условий, адекватных природным (для данного микроорганизма)
6. Кроме того, питательные среды, как и посуда, и другие материалы, должны быть стерильными, т.к. успех микробиологических работ во многом определяется созданием условий надежной стерильности.
Цель процесса стерилизации состоит в удалении или уничтожении всех живых микроорганизмов внутри или на поверхности предмета. Процессы стерилизации и дезинфекции основаны на действии все тех же биофизических или физико-химических факторов: Т, Eh - аэрация, рН, гидростатическое давление и др. Эффективность стерилизации выражается в виде статистической вероятности выживания клеток. По окончании процессов стерилизации вероятность выживания клетки должна составлять не более 10-6.
Факторы, которые надо учитывать при выборе метода стерилизации:
1. Конструкция и химический состав образца, подлежащего стерилизации
2. Биологическое (вегетативные клетки или споры) и физическое (влажность, сухие клетки более устойчивы к каким-либо воздействиям) состояние микроорганизмов в образцах, подлежащих стерилизации.
3. Наследственная устойчивость микроорганизма к стерилизации и скорость его гибели
4. Исходное количество микроорганизмов в стерилизуемом образце
5. Эффективность стерилизующего агента
6. Продолжительность стерилизующего воздействия.
В общем случае для стерилизации используются: 1) пар - культуральные среды, оборудование, стеклянная посуда, 2) сухой жар - стеклянная посуда и металлическое оборудование, 3) газ - инструменты, 4) фильтрация - растворы, 5) в особых случаях применяют радиоактивное облучение.
Воздействие влажным и сухим жаром имеет различный результат. Сухие клетки выдерживают нагревание до гораздо более высоких температур и большее время, чем клетки влажные или в условиях полного насыщения водяными парами (табл. 4).
Таблица 4
Режимы и способы стерилизации
Влажный жар | Сухой жар | ||
Т, °С | Время стерилизации | Т, °С | Время стерилизации |
1 00 | 20 час | 120 | 8 час |
1 09 | 2,5 час | 1 40 | 2,5 час |
115 | 50 мин | 1 60 | 1 час |
121 | 1 5 мин | 1 70 | 25 мин |
126 | 1 0 мин | 1 80 | 10 мин |
1 34 | 3 мин |
Сухой жар применяется для стерилизации стеклянной посуды (пробирок, колб, чашек Петри, пипеток), а также жиров, смазок, минерального масла, восков, порошков.
Для стерилизации сухим жаром используют сухожаровые шкафы (печи Пастера).При обработке сухим жаром микроорганизмы погибают в результате окисления внутриклеточных компонентов. Споры бактерий более устойчивы к сухому жару, чем вегетативные клетки.